三亚市南繁科学技术研究院是市属国有科研事业单位，财政差额拨款单位。2005年4月，为了充分发挥国家南繁育种基地的科技资源优势，建立南繁科技事业地方科研配套支持服务体系，同时适应事业机构体制改革的要求，提升农业科研单位的综合能力，建设热带高效农业科技支撑平台，由市政府批准将原市农业生物技术研究发展中心、市热带瓜果研究中心、市科学技术服务中心、市科学技术情报研究所等4家科研事业机构重组改革合并组建。
    三亚市南繁科学技术研究院的主要工作方向是南繁科研的支持与服务；热带高效农业产业的科技支撑；农业科研与科技推广应用及农业科技110服务等。现有农业科技人员40余人，其中高级职称5名，中级9名，博士2名、硕士8名。在市区建有占地40亩的科研试验及办公区，配套建设了科研办公大楼、综合实验楼、专家接待中心及职工宿舍，建筑面积近6000㎡，配套大量的科研设施设备，目前下设热带瓜菜研究室、植保与热带资源研究室、热带园林花卉研究室、热带果树研究室、土肥与农产品安全研究室、南繁公共开放实验中心、设施农业研究中心和农产品加工研究中心；成立了院属科技开发实体：三亚腾农科技发展有限公司；创办了国家星火农民科技培训学校；并建立了农业科技服务110示范培训基地、田独服务站，槟榔村服务点等。在市南红农场建成占地100亩的水稻育种试验站，在林旺建成占地80亩的西甜瓜与设施栽培科研试验基地，在田独新村田洋建成800亩热带高效农业科技试验示范现场。建有由袁隆平院士题名的杂交水稻网(http://www.agrisci.com)和农业南繁科技服务网(http://www.nanfan.net)。